본문 바로가기

Neuroscience7

[spm] real world coordinate 와 voxel coordinate 변환 FORMAT V = spm_vol(P) V.mat - a 4x4 affine transformation matrix mapping from voxel coordinates to real world coordinates. mat은 복셀스페이스 (복셀스페이스, x로 몇복셀,y로 몇 복셀 ..) -> realworld (mm 단위,, 실제 머리의 크기와 관련된 현실사이즈) cent = AMAP(i).centroid; // cent가 mm단위의 real world 좌표일때. vx = double(inv(aalv.mat)*[cent'; 1]); // aalv.mat의 inv를 곱해주면.. realworld->복셀좌표. vx가 cent로 갈때는 aalv.mat*vx 해주면 cent가 나온다. 2017. 8. 2.
Bayesian approaches to brain function Bayesian approaches to brain function http://en.wikipedia.org/wiki/Bayesian_approaches_to_brain_function 2014. 7. 13.
뇌를 투명하게 보는 방법(Clarity) 개발 이미 한참 지난 이야기 이긴 하나, 재밋는 내용이라 블로그에 소개합니다. 스탠포드에서 박사후 과정으로 연구하던 한국인 정광훈 박사가 뇌를 투명하게 보는 방법을 clarity라는 것을 개발해서 전세계적으로 엄청난 반향을 불러왔죠. 뇌를 꺼내서 약품처리를 해야 되기때문에 살아있는 뇌에는 적용할수 없다는 단점이 있지만, 실로 대단한 발견이라고 해요. 그래서 아주 유명한 과학논문저널 science에서 올해의 발견에 선정하기도 했구요.. 뇌를 투명하게 해서 뭣한다는거냐? 정말 많은 응용이 있을 수 있을텐데 제가 아는 지식선에서 하나만 설명드리자면은 이런 그림 본 적이 있나요? 이건 MRI로 찍은 DTI라는 거예요 뇌의 신경다발을 찍은 다음에 MRI에서 찍은 신경다발은 방향성이 있는 점모양 이라서 그 정보를 토대로.. 2014. 1. 10.
BOLD 신호의 원리, principles of bold signal 그림 출처 : http://www.fmrib.ox.ac.uk/fsl/possum/input.html BOLD(Blood Oxygen Level Dependent signal) 은 fMRI영상이 찍는 바로 그것인데, FMRI Voxel값이 가지는 바로 그 값이 이 BOLD신호 이다. 가볍게 이해하기로는 "뇌신경 활동에 비례하는 신호이다" 로 이해하면 된다. 조금 더 자세히 보면, 산소와 결합한 헤모글로빈은 반자성을 띄고, 산호와 해리된 헤모글로빈은 상자성을 띄는데(헤모글로빈의 Fe가 O2와 붙었다 떨어 졌다가 하니깐..) , BOLD신호는 공급된 O2의 양과 조직에서 소비된 양과 관련이 있다.(절대 량이 아니고 비율..) 정맥 내에서 Hb중 deoxyHb이 차지하는 비율의 감소가 BOLD 신호의 직접적인 .. 2012. 6. 24.